Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RPS6KB1P23443 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RPS6KB1P23443 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RPS6KB1P23443 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RPS6KB1P23443 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RPS6KB1P23443 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RPS6KB1P23443 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RPS6KB1P23443 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RPS6KB1P23443 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RPS6KB1P23443 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RPS6KB1P23443 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RPS6KB1P23443 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RPS6KB1P23443 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RPS6KB1P23443 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
RPS6KB1P23443 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RPS6KB1P23443 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
RPS6KB1P23443 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RPS6KB1P23443 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RPS6KB1P23443 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RPS6KB1P23443 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RPS6KB1P23443 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RPS6KB1P23443 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RPS6KB1P23443 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RPS6KB1P23443 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RPS6KB1P23443 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RPS6KB1P23443 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RPS6KB1P23443 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RPS6KB1P23443 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RPS6KB1P23443 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RPS6KB1P23443 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RPS6KB1P23443 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RPS6KB1P23443 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RPS6KB1P23443 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RPS6KB1P23443 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RPS6KB1P23443 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RPS6KB1P23443 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RPS6KB1P23443 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RPS6KB1P23443 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RPS6KB1P23443 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RPS6KB1P23443 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RPS6KB1P23443 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RPS6KB1P23443 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RPS6KB1P23443 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RPS6KB1P23443 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RPS6KB1P23443 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RPS6KB1P23443 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RPS6KB1P23443 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RPS6KB1P23443 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RPS6KB1P23443 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RPS6KB1P23443 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RPS6KB1P23443 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
RPS6KB1P23443 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RPS6KB1P23443 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RPS6KB1P23443 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RPS6KB1P23443 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RPS6KB1P23443 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC28■■■□□ 2.07
RPS6KB1P23443 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28■■■□□ 2.07
RPS6KB1P23443 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RPS6KB1P23443 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28■■■□□ 2.07
RPS6KB1P23443 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RPS6KB1P23443 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RPS6KB1P23443 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RPS6KB1P23443 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RPS6KB1P23443 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RPS6KB1P23443 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RPS6KB1P23443 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RPS6KB1P23443 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RPS6KB1P23443 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RPS6KB1P23443 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RPS6KB1P23443 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RPS6KB1P23443 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RPS6KB1P23443 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RPS6KB1P23443 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RPS6KB1P23443 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
RPS6KB1P23443 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RPS6KB1P23443 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RPS6KB1P23443 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RPS6KB1P23443 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RPS6KB1P23443 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RPS6KB1P23443 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RPS6KB1P23443 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RPS6KB1P23443 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
RPS6KB1P23443 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RPS6KB1P23443 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RPS6KB1P23443 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RPS6KB1P23443 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RPS6KB1P23443 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RPS6KB1P23443 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RPS6KB1P23443 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RPS6KB1P23443 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RPS6KB1P23443 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RPS6KB1P23443 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RPS6KB1P23443 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RPS6KB1P23443 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RPS6KB1P23443 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RPS6KB1P23443 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RPS6KB1P23443 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RPS6KB1P23443 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RPS6KB1P23443 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RPS6KB1P23443 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms