Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDK11BP21127 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDK11BP21127 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDK11BP21127 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDK11BP21127 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDK11BP21127 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDK11BP21127 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDK11BP21127 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDK11BP21127 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDK11BP21127 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDK11BP21127 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDK11BP21127 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDK11BP21127 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
CDK11BP21127 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CDK11BP21127 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDK11BP21127 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDK11BP21127 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDK11BP21127 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDK11BP21127 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDK11BP21127 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDK11BP21127 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDK11BP21127 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDK11BP21127 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDK11BP21127 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDK11BP21127 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDK11BP21127 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDK11BP21127 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDK11BP21127 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDK11BP21127 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDK11BP21127 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDK11BP21127 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDK11BP21127 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDK11BP21127 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDK11BP21127 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDK11BP21127 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDK11BP21127 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDK11BP21127 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDK11BP21127 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDK11BP21127 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDK11BP21127 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDK11BP21127 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDK11BP21127 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDK11BP21127 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDK11BP21127 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDK11BP21127 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDK11BP21127 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDK11BP21127 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDK11BP21127 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDK11BP21127 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDK11BP21127 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDK11BP21127 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDK11BP21127 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CDK11BP21127 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDK11BP21127 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDK11BP21127 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDK11BP21127 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDK11BP21127 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDK11BP21127 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDK11BP21127 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDK11BP21127 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDK11BP21127 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDK11BP21127 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDK11BP21127 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDK11BP21127 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDK11BP21127 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDK11BP21127 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDK11BP21127 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDK11BP21127 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDK11BP21127 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDK11BP21127 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CDK11BP21127 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDK11BP21127 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDK11BP21127 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDK11BP21127 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDK11BP21127 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDK11BP21127 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDK11BP21127 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDK11BP21127 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDK11BP21127 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDK11BP21127 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDK11BP21127 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDK11BP21127 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDK11BP21127 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDK11BP21127 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDK11BP21127 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDK11BP21127 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDK11BP21127 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDK11BP21127 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDK11BP21127 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDK11BP21127 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDK11BP21127 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDK11BP21127 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDK11BP21127 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CDK11BP21127 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDK11BP21127 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDK11BP21127 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDK11BP21127 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDK11BP21127 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDK11BP21127 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDK11BP21127 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms