Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC9A1P19634 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC9A1P19634 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC9A1P19634 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC9A1P19634 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC9A1P19634 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC9A1P19634 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC9A1P19634 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC9A1P19634 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC9A1P19634 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC9A1P19634 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SLC9A1P19634 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SLC9A1P19634 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC9A1P19634 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC9A1P19634 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC9A1P19634 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC9A1P19634 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC9A1P19634 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC9A1P19634 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC9A1P19634 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC9A1P19634 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC9A1P19634 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC9A1P19634 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC9A1P19634 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC9A1P19634 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC9A1P19634 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC9A1P19634 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC9A1P19634 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC9A1P19634 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC9A1P19634 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC9A1P19634 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC9A1P19634 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC9A1P19634 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC9A1P19634 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC9A1P19634 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC9A1P19634 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC9A1P19634 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC9A1P19634 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC9A1P19634 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC9A1P19634 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC9A1P19634 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC9A1P19634 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC9A1P19634 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC9A1P19634 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC9A1P19634 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC9A1P19634 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC9A1P19634 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC9A1P19634 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC9A1P19634 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC9A1P19634 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC9A1P19634 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC9A1P19634 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SLC9A1P19634 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SLC9A1P19634 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC9A1P19634 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC9A1P19634 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC9A1P19634 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC9A1P19634 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC9A1P19634 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC9A1P19634 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC9A1P19634 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC9A1P19634 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC9A1P19634 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC9A1P19634 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC9A1P19634 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC9A1P19634 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC9A1P19634 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC9A1P19634 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC9A1P19634 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC9A1P19634 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC9A1P19634 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC9A1P19634 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC9A1P19634 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC9A1P19634 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC9A1P19634 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC9A1P19634 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC9A1P19634 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC9A1P19634 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC9A1P19634 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC9A1P19634 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC9A1P19634 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC9A1P19634 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC9A1P19634 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC9A1P19634 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC9A1P19634 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC9A1P19634 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC9A1P19634 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC9A1P19634 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC9A1P19634 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SLC9A1P19634 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC9A1P19634 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC9A1P19634 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC9A1P19634 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC9A1P19634 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC9A1P19634 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC9A1P19634 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC9A1P19634 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC9A1P19634 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC9A1P19634 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC9A1P19634 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms