Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTLA4P16410 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTLA4P16410 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTLA4P16410 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTLA4P16410 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTLA4P16410 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTLA4P16410 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTLA4P16410 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTLA4P16410 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTLA4P16410 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTLA4P16410 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTLA4P16410 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTLA4P16410 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTLA4P16410 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CTLA4P16410 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTLA4P16410 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTLA4P16410 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTLA4P16410 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTLA4P16410 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTLA4P16410 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTLA4P16410 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTLA4P16410 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTLA4P16410 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTLA4P16410 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTLA4P16410 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTLA4P16410 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTLA4P16410 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTLA4P16410 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CTLA4P16410 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTLA4P16410 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTLA4P16410 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTLA4P16410 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTLA4P16410 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTLA4P16410 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTLA4P16410 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTLA4P16410 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTLA4P16410 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTLA4P16410 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTLA4P16410 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTLA4P16410 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTLA4P16410 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTLA4P16410 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTLA4P16410 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTLA4P16410 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTLA4P16410 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTLA4P16410 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTLA4P16410 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTLA4P16410 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTLA4P16410 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTLA4P16410 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CTLA4P16410 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTLA4P16410 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTLA4P16410 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTLA4P16410 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTLA4P16410 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTLA4P16410 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTLA4P16410 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTLA4P16410 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTLA4P16410 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTLA4P16410 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTLA4P16410 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTLA4P16410 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTLA4P16410 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTLA4P16410 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTLA4P16410 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
CTLA4P16410 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CTLA4P16410 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CTLA4P16410 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTLA4P16410 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTLA4P16410 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTLA4P16410 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTLA4P16410 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTLA4P16410 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CTLA4P16410 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CTLA4P16410 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CTLA4P16410 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTLA4P16410 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTLA4P16410 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTLA4P16410 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTLA4P16410 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTLA4P16410 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTLA4P16410 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CTLA4P16410 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTLA4P16410 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTLA4P16410 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTLA4P16410 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTLA4P16410 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTLA4P16410 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTLA4P16410 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTLA4P16410 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTLA4P16410 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTLA4P16410 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTLA4P16410 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTLA4P16410 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTLA4P16410 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTLA4P16410 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTLA4P16410 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTLA4P16410 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTLA4P16410 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTLA4P16410 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms