Protein–RNA interactions for Protein: P14314

PRKCSH, Glucosidase 2 subunit beta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCSHP14314 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRKCSHP14314 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRKCSHP14314 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRKCSHP14314 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRKCSHP14314 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRKCSHP14314 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRKCSHP14314 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRKCSHP14314 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRKCSHP14314 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRKCSHP14314 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRKCSHP14314 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRKCSHP14314 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
PRKCSHP14314 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRKCSHP14314 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRKCSHP14314 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
PRKCSHP14314 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRKCSHP14314 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRKCSHP14314 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRKCSHP14314 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRKCSHP14314 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRKCSHP14314 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRKCSHP14314 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRKCSHP14314 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRKCSHP14314 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRKCSHP14314 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PRKCSHP14314 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PRKCSHP14314 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRKCSHP14314 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRKCSHP14314 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRKCSHP14314 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PRKCSHP14314 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRKCSHP14314 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRKCSHP14314 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRKCSHP14314 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRKCSHP14314 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRKCSHP14314 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRKCSHP14314 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRKCSHP14314 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRKCSHP14314 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRKCSHP14314 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRKCSHP14314 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRKCSHP14314 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRKCSHP14314 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRKCSHP14314 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRKCSHP14314 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRKCSHP14314 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRKCSHP14314 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRKCSHP14314 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRKCSHP14314 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRKCSHP14314 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRKCSHP14314 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRKCSHP14314 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PRKCSHP14314 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRKCSHP14314 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRKCSHP14314 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PRKCSHP14314 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRKCSHP14314 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRKCSHP14314 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRKCSHP14314 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRKCSHP14314 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRKCSHP14314 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRKCSHP14314 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRKCSHP14314 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRKCSHP14314 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRKCSHP14314 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PRKCSHP14314 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
PRKCSHP14314 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRKCSHP14314 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRKCSHP14314 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRKCSHP14314 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRKCSHP14314 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRKCSHP14314 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRKCSHP14314 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRKCSHP14314 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRKCSHP14314 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRKCSHP14314 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRKCSHP14314 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRKCSHP14314 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRKCSHP14314 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRKCSHP14314 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRKCSHP14314 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRKCSHP14314 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRKCSHP14314 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRKCSHP14314 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRKCSHP14314 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRKCSHP14314 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRKCSHP14314 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRKCSHP14314 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRKCSHP14314 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRKCSHP14314 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRKCSHP14314 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRKCSHP14314 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRKCSHP14314 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRKCSHP14314 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRKCSHP14314 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRKCSHP14314 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRKCSHP14314 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRKCSHP14314 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRKCSHP14314 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRKCSHP14314 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms