Protein–RNA interactions for Protein: P12035

KRT3, Keratin, type II cytoskeletal 3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT3P12035 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT3P12035 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT3P12035 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT3P12035 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT3P12035 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT3P12035 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT3P12035 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT3P12035 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT3P12035 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT3P12035 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT3P12035 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT3P12035 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT3P12035 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT3P12035 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT3P12035 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT3P12035 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT3P12035 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT3P12035 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT3P12035 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT3P12035 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT3P12035 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT3P12035 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT3P12035 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT3P12035 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT3P12035 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT3P12035 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
KRT3P12035 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
KRT3P12035 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT3P12035 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT3P12035 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT3P12035 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT3P12035 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT3P12035 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT3P12035 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT3P12035 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT3P12035 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT3P12035 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT3P12035 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT3P12035 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT3P12035 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT3P12035 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT3P12035 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT3P12035 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT3P12035 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT3P12035 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT3P12035 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT3P12035 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT3P12035 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT3P12035 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT3P12035 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT3P12035 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT3P12035 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT3P12035 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT3P12035 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT3P12035 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT3P12035 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT3P12035 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT3P12035 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT3P12035 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT3P12035 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT3P12035 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT3P12035 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT3P12035 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT3P12035 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT3P12035 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT3P12035 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT3P12035 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT3P12035 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT3P12035 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT3P12035 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT3P12035 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT3P12035 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT3P12035 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KRT3P12035 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KRT3P12035 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT3P12035 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT3P12035 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT3P12035 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT3P12035 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT3P12035 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT3P12035 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT3P12035 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT3P12035 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT3P12035 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT3P12035 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT3P12035 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT3P12035 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT3P12035 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT3P12035 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT3P12035 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT3P12035 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT3P12035 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT3P12035 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT3P12035 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT3P12035 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT3P12035 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT3P12035 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT3P12035 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT3P12035 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT3P12035 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms