Protein–RNA interactions for Protein: P0DM63

NPIPA8, Nuclear pore complex-interacting protein family member A8, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA8P0DM63 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPIPA8P0DM63 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPIPA8P0DM63 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPIPA8P0DM63 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPIPA8P0DM63 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPIPA8P0DM63 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NPIPA8P0DM63 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NPIPA8P0DM63 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NPIPA8P0DM63 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NPIPA8P0DM63 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NPIPA8P0DM63 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NPIPA8P0DM63 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NPIPA8P0DM63 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NPIPA8P0DM63 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NPIPA8P0DM63 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NPIPA8P0DM63 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NPIPA8P0DM63 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NPIPA8P0DM63 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NPIPA8P0DM63 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NPIPA8P0DM63 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NPIPA8P0DM63 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NPIPA8P0DM63 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NPIPA8P0DM63 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NPIPA8P0DM63 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NPIPA8P0DM63 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NPIPA8P0DM63 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NPIPA8P0DM63 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NPIPA8P0DM63 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NPIPA8P0DM63 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NPIPA8P0DM63 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NPIPA8P0DM63 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NPIPA8P0DM63 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NPIPA8P0DM63 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NPIPA8P0DM63 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NPIPA8P0DM63 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NPIPA8P0DM63 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NPIPA8P0DM63 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NPIPA8P0DM63 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NPIPA8P0DM63 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NPIPA8P0DM63 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NPIPA8P0DM63 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NPIPA8P0DM63 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NPIPA8P0DM63 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NPIPA8P0DM63 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NPIPA8P0DM63 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NPIPA8P0DM63 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NPIPA8P0DM63 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NPIPA8P0DM63 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NPIPA8P0DM63 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NPIPA8P0DM63 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NPIPA8P0DM63 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NPIPA8P0DM63 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NPIPA8P0DM63 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NPIPA8P0DM63 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NPIPA8P0DM63 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NPIPA8P0DM63 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NPIPA8P0DM63 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NPIPA8P0DM63 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NPIPA8P0DM63 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPIPA8P0DM63 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPIPA8P0DM63 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPIPA8P0DM63 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPIPA8P0DM63 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NPIPA8P0DM63 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPIPA8P0DM63 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPIPA8P0DM63 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPIPA8P0DM63 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPIPA8P0DM63 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPIPA8P0DM63 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NPIPA8P0DM63 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NPIPA8P0DM63 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NPIPA8P0DM63 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NPIPA8P0DM63 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NPIPA8P0DM63 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NPIPA8P0DM63 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NPIPA8P0DM63 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NPIPA8P0DM63 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NPIPA8P0DM63 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NPIPA8P0DM63 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NPIPA8P0DM63 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NPIPA8P0DM63 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NPIPA8P0DM63 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NPIPA8P0DM63 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NPIPA8P0DM63 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NPIPA8P0DM63 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NPIPA8P0DM63 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NPIPA8P0DM63 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NPIPA8P0DM63 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NPIPA8P0DM63 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NPIPA8P0DM63 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NPIPA8P0DM63 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NPIPA8P0DM63 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NPIPA8P0DM63 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NPIPA8P0DM63 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NPIPA8P0DM63 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NPIPA8P0DM63 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NPIPA8P0DM63 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NPIPA8P0DM63 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NPIPA8P0DM63 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NPIPA8P0DM63 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms