Protein–RNA interactions for Protein: P08183

ABCB1, Multidrug resistance protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB1P08183 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ABCB1P08183 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ABCB1P08183 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABCB1P08183 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABCB1P08183 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABCB1P08183 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ABCB1P08183 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABCB1P08183 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABCB1P08183 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABCB1P08183 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABCB1P08183 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABCB1P08183 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ABCB1P08183 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ABCB1P08183 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ABCB1P08183 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ABCB1P08183 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ABCB1P08183 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCB1P08183 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCB1P08183 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCB1P08183 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCB1P08183 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCB1P08183 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCB1P08183 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCB1P08183 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCB1P08183 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCB1P08183 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCB1P08183 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCB1P08183 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCB1P08183 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCB1P08183 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCB1P08183 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCB1P08183 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCB1P08183 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCB1P08183 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCB1P08183 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCB1P08183 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCB1P08183 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCB1P08183 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCB1P08183 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCB1P08183 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCB1P08183 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCB1P08183 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCB1P08183 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCB1P08183 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCB1P08183 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCB1P08183 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCB1P08183 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCB1P08183 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCB1P08183 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCB1P08183 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCB1P08183 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCB1P08183 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCB1P08183 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCB1P08183 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCB1P08183 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCB1P08183 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCB1P08183 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCB1P08183 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCB1P08183 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCB1P08183 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCB1P08183 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCB1P08183 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCB1P08183 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCB1P08183 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCB1P08183 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCB1P08183 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCB1P08183 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCB1P08183 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCB1P08183 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCB1P08183 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCB1P08183 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCB1P08183 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCB1P08183 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCB1P08183 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCB1P08183 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCB1P08183 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCB1P08183 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCB1P08183 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCB1P08183 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCB1P08183 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCB1P08183 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCB1P08183 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCB1P08183 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCB1P08183 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCB1P08183 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCB1P08183 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCB1P08183 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCB1P08183 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCB1P08183 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCB1P08183 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCB1P08183 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCB1P08183 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCB1P08183 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCB1P08183 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ABCB1P08183 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ABCB1P08183 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCB1P08183 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCB1P08183 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCB1P08183 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCB1P08183 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms