Protein–RNA interactions for Protein: P07358

C8B, Complement component C8 beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8BP07358 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C8BP07358 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C8BP07358 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C8BP07358 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C8BP07358 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C8BP07358 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C8BP07358 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C8BP07358 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C8BP07358 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C8BP07358 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C8BP07358 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C8BP07358 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C8BP07358 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C8BP07358 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C8BP07358 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C8BP07358 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C8BP07358 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C8BP07358 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C8BP07358 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C8BP07358 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C8BP07358 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C8BP07358 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C8BP07358 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
C8BP07358 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C8BP07358 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C8BP07358 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C8BP07358 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
C8BP07358 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C8BP07358 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C8BP07358 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C8BP07358 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C8BP07358 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C8BP07358 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C8BP07358 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C8BP07358 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C8BP07358 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C8BP07358 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
C8BP07358 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C8BP07358 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C8BP07358 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C8BP07358 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C8BP07358 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C8BP07358 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C8BP07358 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C8BP07358 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C8BP07358 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C8BP07358 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C8BP07358 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C8BP07358 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C8BP07358 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C8BP07358 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C8BP07358 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C8BP07358 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C8BP07358 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
C8BP07358 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C8BP07358 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C8BP07358 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C8BP07358 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C8BP07358 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C8BP07358 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C8BP07358 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C8BP07358 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C8BP07358 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C8BP07358 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C8BP07358 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C8BP07358 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C8BP07358 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C8BP07358 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C8BP07358 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C8BP07358 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C8BP07358 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C8BP07358 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C8BP07358 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C8BP07358 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C8BP07358 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C8BP07358 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C8BP07358 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C8BP07358 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C8BP07358 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C8BP07358 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C8BP07358 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C8BP07358 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C8BP07358 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
C8BP07358 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C8BP07358 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C8BP07358 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
C8BP07358 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C8BP07358 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C8BP07358 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C8BP07358 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
C8BP07358 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C8BP07358 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C8BP07358 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C8BP07358 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
C8BP07358 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C8BP07358 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C8BP07358 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C8BP07358 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C8BP07358 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C8BP07358 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.2 ms