Protein–RNA interactions for Protein: P02654

APOC1, Apolipoprotein C-I, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC1P02654 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
APOC1P02654 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOC1P02654 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOC1P02654 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOC1P02654 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOC1P02654 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOC1P02654 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOC1P02654 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOC1P02654 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOC1P02654 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
APOC1P02654 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOC1P02654 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOC1P02654 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOC1P02654 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOC1P02654 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOC1P02654 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
APOC1P02654 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
APOC1P02654 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
APOC1P02654 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
APOC1P02654 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
APOC1P02654 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
APOC1P02654 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
APOC1P02654 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
APOC1P02654 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
APOC1P02654 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
APOC1P02654 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
APOC1P02654 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
APOC1P02654 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
APOC1P02654 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
APOC1P02654 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
APOC1P02654 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
APOC1P02654 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
APOC1P02654 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
APOC1P02654 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
APOC1P02654 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
APOC1P02654 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
APOC1P02654 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
APOC1P02654 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
APOC1P02654 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
APOC1P02654 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
APOC1P02654 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
APOC1P02654 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
APOC1P02654 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
APOC1P02654 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
APOC1P02654 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
APOC1P02654 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
APOC1P02654 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
APOC1P02654 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
APOC1P02654 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
APOC1P02654 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
APOC1P02654 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
APOC1P02654 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
APOC1P02654 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOC1P02654 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOC1P02654 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOC1P02654 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOC1P02654 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOC1P02654 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOC1P02654 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOC1P02654 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOC1P02654 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOC1P02654 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOC1P02654 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOC1P02654 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOC1P02654 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOC1P02654 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOC1P02654 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOC1P02654 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOC1P02654 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOC1P02654 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOC1P02654 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOC1P02654 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
APOC1P02654 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOC1P02654 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
APOC1P02654 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
APOC1P02654 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
APOC1P02654 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
APOC1P02654 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
APOC1P02654 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
APOC1P02654 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
APOC1P02654 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
APOC1P02654 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
APOC1P02654 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
APOC1P02654 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
APOC1P02654 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
APOC1P02654 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
APOC1P02654 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
APOC1P02654 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
APOC1P02654 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
APOC1P02654 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
APOC1P02654 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
APOC1P02654 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
APOC1P02654 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
APOC1P02654 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
APOC1P02654 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
APOC1P02654 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
APOC1P02654 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
APOC1P02654 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
APOC1P02654 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
APOC1P02654 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms