Protein–RNA interactions for Protein: P01857

IGHG1, Immunoglobulin heavy constant gamma 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHG1P01857 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IGHG1P01857 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IGHG1P01857 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IGHG1P01857 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IGHG1P01857 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IGHG1P01857 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IGHG1P01857 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IGHG1P01857 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IGHG1P01857 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
IGHG1P01857 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IGHG1P01857 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IGHG1P01857 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
IGHG1P01857 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
IGHG1P01857 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
IGHG1P01857 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IGHG1P01857 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
IGHG1P01857 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
IGHG1P01857 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
IGHG1P01857 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
IGHG1P01857 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
IGHG1P01857 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
IGHG1P01857 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
IGHG1P01857 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
IGHG1P01857 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
IGHG1P01857 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
IGHG1P01857 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
IGHG1P01857 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
IGHG1P01857 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
IGHG1P01857 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
IGHG1P01857 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
IGHG1P01857 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IGHG1P01857 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IGHG1P01857 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
IGHG1P01857 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IGHG1P01857 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IGHG1P01857 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
IGHG1P01857 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IGHG1P01857 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IGHG1P01857 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IGHG1P01857 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
IGHG1P01857 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
IGHG1P01857 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IGHG1P01857 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IGHG1P01857 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IGHG1P01857 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IGHG1P01857 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IGHG1P01857 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
IGHG1P01857 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IGHG1P01857 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IGHG1P01857 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IGHG1P01857 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IGHG1P01857 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
IGHG1P01857 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
IGHG1P01857 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
IGHG1P01857 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IGHG1P01857 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IGHG1P01857 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
IGHG1P01857 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
IGHG1P01857 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
IGHG1P01857 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
IGHG1P01857 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
IGHG1P01857 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IGHG1P01857 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
IGHG1P01857 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IGHG1P01857 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
IGHG1P01857 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IGHG1P01857 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IGHG1P01857 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
IGHG1P01857 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
IGHG1P01857 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IGHG1P01857 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IGHG1P01857 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
IGHG1P01857 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
IGHG1P01857 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
IGHG1P01857 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
IGHG1P01857 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
IGHG1P01857 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
IGHG1P01857 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
IGHG1P01857 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
IGHG1P01857 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
IGHG1P01857 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
IGHG1P01857 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IGHG1P01857 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IGHG1P01857 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
IGHG1P01857 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IGHG1P01857 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
IGHG1P01857 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
IGHG1P01857 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IGHG1P01857 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21■□□□□ 0.95
IGHG1P01857 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21■□□□□ 0.95
IGHG1P01857 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
IGHG1P01857 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
IGHG1P01857 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
IGHG1P01857 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
IGHG1P01857 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
IGHG1P01857 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
IGHG1P01857 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
IGHG1P01857 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
IGHG1P01857 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
IGHG1P01857 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms