Protein–RNA interactions for Protein: P01137

TGFB1, Transforming growth factor beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFB1P01137 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TGFB1P01137 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TGFB1P01137 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TGFB1P01137 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TGFB1P01137 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TGFB1P01137 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TGFB1P01137 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TGFB1P01137 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TGFB1P01137 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TGFB1P01137 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TGFB1P01137 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TGFB1P01137 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TGFB1P01137 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TGFB1P01137 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TGFB1P01137 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TGFB1P01137 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TGFB1P01137 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TGFB1P01137 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TGFB1P01137 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TGFB1P01137 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TGFB1P01137 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TGFB1P01137 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TGFB1P01137 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TGFB1P01137 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TGFB1P01137 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TGFB1P01137 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TGFB1P01137 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TGFB1P01137 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TGFB1P01137 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TGFB1P01137 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TGFB1P01137 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TGFB1P01137 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TGFB1P01137 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TGFB1P01137 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TGFB1P01137 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TGFB1P01137 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TGFB1P01137 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TGFB1P01137 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TGFB1P01137 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TGFB1P01137 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TGFB1P01137 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TGFB1P01137 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TGFB1P01137 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TGFB1P01137 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TGFB1P01137 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TGFB1P01137 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TGFB1P01137 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TGFB1P01137 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TGFB1P01137 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TGFB1P01137 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TGFB1P01137 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TGFB1P01137 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TGFB1P01137 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TGFB1P01137 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TGFB1P01137 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TGFB1P01137 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TGFB1P01137 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TGFB1P01137 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TGFB1P01137 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TGFB1P01137 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TGFB1P01137 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TGFB1P01137 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TGFB1P01137 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TGFB1P01137 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TGFB1P01137 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TGFB1P01137 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TGFB1P01137 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TGFB1P01137 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TGFB1P01137 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TGFB1P01137 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TGFB1P01137 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TGFB1P01137 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TGFB1P01137 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TGFB1P01137 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TGFB1P01137 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TGFB1P01137 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TGFB1P01137 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TGFB1P01137 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TGFB1P01137 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TGFB1P01137 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TGFB1P01137 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TGFB1P01137 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TGFB1P01137 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TGFB1P01137 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TGFB1P01137 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TGFB1P01137 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TGFB1P01137 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TGFB1P01137 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TGFB1P01137 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TGFB1P01137 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TGFB1P01137 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TGFB1P01137 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TGFB1P01137 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TGFB1P01137 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TGFB1P01137 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TGFB1P01137 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TGFB1P01137 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TGFB1P01137 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TGFB1P01137 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TGFB1P01137 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms