Protein–RNA interactions for Protein: P01130

LDLR, Low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRP01130 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LDLRP01130 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LDLRP01130 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LDLRP01130 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LDLRP01130 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LDLRP01130 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LDLRP01130 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LDLRP01130 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LDLRP01130 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LDLRP01130 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LDLRP01130 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LDLRP01130 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LDLRP01130 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LDLRP01130 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LDLRP01130 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LDLRP01130 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LDLRP01130 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LDLRP01130 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LDLRP01130 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LDLRP01130 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LDLRP01130 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LDLRP01130 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LDLRP01130 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LDLRP01130 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LDLRP01130 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LDLRP01130 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LDLRP01130 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LDLRP01130 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LDLRP01130 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LDLRP01130 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LDLRP01130 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LDLRP01130 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LDLRP01130 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LDLRP01130 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LDLRP01130 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LDLRP01130 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LDLRP01130 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LDLRP01130 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LDLRP01130 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LDLRP01130 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LDLRP01130 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LDLRP01130 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LDLRP01130 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LDLRP01130 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LDLRP01130 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LDLRP01130 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LDLRP01130 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LDLRP01130 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LDLRP01130 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LDLRP01130 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LDLRP01130 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LDLRP01130 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LDLRP01130 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LDLRP01130 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LDLRP01130 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LDLRP01130 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LDLRP01130 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LDLRP01130 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LDLRP01130 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LDLRP01130 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LDLRP01130 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LDLRP01130 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LDLRP01130 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LDLRP01130 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LDLRP01130 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LDLRP01130 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LDLRP01130 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LDLRP01130 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LDLRP01130 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LDLRP01130 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LDLRP01130 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LDLRP01130 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LDLRP01130 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LDLRP01130 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LDLRP01130 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LDLRP01130 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LDLRP01130 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LDLRP01130 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LDLRP01130 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LDLRP01130 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LDLRP01130 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LDLRP01130 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LDLRP01130 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LDLRP01130 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LDLRP01130 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LDLRP01130 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LDLRP01130 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LDLRP01130 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LDLRP01130 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LDLRP01130 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LDLRP01130 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LDLRP01130 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LDLRP01130 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LDLRP01130 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LDLRP01130 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LDLRP01130 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LDLRP01130 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LDLRP01130 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LDLRP01130 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LDLRP01130 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms