Protein–RNA interactions for Protein: O75909

CCNK, Cyclin-K, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNKO75909 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCNKO75909 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CCNKO75909 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCNKO75909 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCNKO75909 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCNKO75909 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCNKO75909 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCNKO75909 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCNKO75909 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCNKO75909 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCNKO75909 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCNKO75909 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCNKO75909 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCNKO75909 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCNKO75909 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCNKO75909 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCNKO75909 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCNKO75909 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCNKO75909 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCNKO75909 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCNKO75909 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCNKO75909 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCNKO75909 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCNKO75909 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCNKO75909 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CCNKO75909 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCNKO75909 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCNKO75909 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCNKO75909 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCNKO75909 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCNKO75909 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCNKO75909 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCNKO75909 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCNKO75909 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCNKO75909 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCNKO75909 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCNKO75909 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCNKO75909 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCNKO75909 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCNKO75909 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCNKO75909 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCNKO75909 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCNKO75909 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCNKO75909 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCNKO75909 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCNKO75909 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCNKO75909 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCNKO75909 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCNKO75909 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCNKO75909 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCNKO75909 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCNKO75909 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCNKO75909 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCNKO75909 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCNKO75909 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
CCNKO75909 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC20.45■□□□□ 0.87
CCNKO75909 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCNKO75909 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCNKO75909 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCNKO75909 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCNKO75909 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCNKO75909 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CCNKO75909 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCNKO75909 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCNKO75909 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCNKO75909 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCNKO75909 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCNKO75909 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCNKO75909 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCNKO75909 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCNKO75909 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCNKO75909 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCNKO75909 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCNKO75909 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCNKO75909 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCNKO75909 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCNKO75909 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCNKO75909 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCNKO75909 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCNKO75909 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCNKO75909 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CCNKO75909 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCNKO75909 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCNKO75909 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCNKO75909 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCNKO75909 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCNKO75909 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCNKO75909 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCNKO75909 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCNKO75909 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCNKO75909 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCNKO75909 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CCNKO75909 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCNKO75909 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCNKO75909 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCNKO75909 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCNKO75909 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCNKO75909 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCNKO75909 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCNKO75909 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms