Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NIPSNAP2O75323 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NIPSNAP2O75323 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NIPSNAP2O75323 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NIPSNAP2O75323 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NIPSNAP2O75323 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NIPSNAP2O75323 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NIPSNAP2O75323 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NIPSNAP2O75323 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NIPSNAP2O75323 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NIPSNAP2O75323 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NIPSNAP2O75323 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NIPSNAP2O75323 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NIPSNAP2O75323 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NIPSNAP2O75323 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NIPSNAP2O75323 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NIPSNAP2O75323 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NIPSNAP2O75323 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NIPSNAP2O75323 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NIPSNAP2O75323 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NIPSNAP2O75323 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NIPSNAP2O75323 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NIPSNAP2O75323 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NIPSNAP2O75323 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NIPSNAP2O75323 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NIPSNAP2O75323 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NIPSNAP2O75323 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NIPSNAP2O75323 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NIPSNAP2O75323 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NIPSNAP2O75323 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NIPSNAP2O75323 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NIPSNAP2O75323 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NIPSNAP2O75323 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NIPSNAP2O75323 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NIPSNAP2O75323 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NIPSNAP2O75323 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NIPSNAP2O75323 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NIPSNAP2O75323 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NIPSNAP2O75323 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NIPSNAP2O75323 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NIPSNAP2O75323 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NIPSNAP2O75323 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NIPSNAP2O75323 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NIPSNAP2O75323 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NIPSNAP2O75323 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NIPSNAP2O75323 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NIPSNAP2O75323 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NIPSNAP2O75323 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NIPSNAP2O75323 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NIPSNAP2O75323 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NIPSNAP2O75323 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NIPSNAP2O75323 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NIPSNAP2O75323 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NIPSNAP2O75323 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NIPSNAP2O75323 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NIPSNAP2O75323 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NIPSNAP2O75323 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NIPSNAP2O75323 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NIPSNAP2O75323 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NIPSNAP2O75323 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NIPSNAP2O75323 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NIPSNAP2O75323 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NIPSNAP2O75323 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NIPSNAP2O75323 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NIPSNAP2O75323 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NIPSNAP2O75323 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NIPSNAP2O75323 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NIPSNAP2O75323 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NIPSNAP2O75323 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NIPSNAP2O75323 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NIPSNAP2O75323 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NIPSNAP2O75323 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NIPSNAP2O75323 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NIPSNAP2O75323 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NIPSNAP2O75323 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NIPSNAP2O75323 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NIPSNAP2O75323 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NIPSNAP2O75323 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NIPSNAP2O75323 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NIPSNAP2O75323 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NIPSNAP2O75323 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NIPSNAP2O75323 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NIPSNAP2O75323 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NIPSNAP2O75323 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NIPSNAP2O75323 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NIPSNAP2O75323 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NIPSNAP2O75323 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NIPSNAP2O75323 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NIPSNAP2O75323 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NIPSNAP2O75323 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NIPSNAP2O75323 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NIPSNAP2O75323 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NIPSNAP2O75323 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NIPSNAP2O75323 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NIPSNAP2O75323 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NIPSNAP2O75323 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NIPSNAP2O75323 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NIPSNAP2O75323 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NIPSNAP2O75323 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NIPSNAP2O75323 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms