Protein–RNA interactions for Protein: O75192

PEX11A, Peroxisomal membrane protein 11A, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX11AO75192 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PEX11AO75192 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PEX11AO75192 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PEX11AO75192 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PEX11AO75192 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PEX11AO75192 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PEX11AO75192 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PEX11AO75192 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PEX11AO75192 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PEX11AO75192 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PEX11AO75192 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PEX11AO75192 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PEX11AO75192 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PEX11AO75192 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PEX11AO75192 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PEX11AO75192 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PEX11AO75192 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PEX11AO75192 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PEX11AO75192 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PEX11AO75192 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PEX11AO75192 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PEX11AO75192 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PEX11AO75192 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PEX11AO75192 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PEX11AO75192 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PEX11AO75192 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PEX11AO75192 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PEX11AO75192 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PEX11AO75192 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PEX11AO75192 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PEX11AO75192 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PEX11AO75192 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PEX11AO75192 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PEX11AO75192 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PEX11AO75192 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PEX11AO75192 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PEX11AO75192 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PEX11AO75192 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PEX11AO75192 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PEX11AO75192 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PEX11AO75192 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PEX11AO75192 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PEX11AO75192 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PEX11AO75192 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PEX11AO75192 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PEX11AO75192 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PEX11AO75192 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PEX11AO75192 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PEX11AO75192 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PEX11AO75192 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PEX11AO75192 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PEX11AO75192 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PEX11AO75192 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PEX11AO75192 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PEX11AO75192 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PEX11AO75192 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PEX11AO75192 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PEX11AO75192 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PEX11AO75192 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PEX11AO75192 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PEX11AO75192 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PEX11AO75192 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PEX11AO75192 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PEX11AO75192 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PEX11AO75192 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PEX11AO75192 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PEX11AO75192 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PEX11AO75192 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PEX11AO75192 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PEX11AO75192 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PEX11AO75192 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PEX11AO75192 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PEX11AO75192 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PEX11AO75192 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PEX11AO75192 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PEX11AO75192 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PEX11AO75192 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PEX11AO75192 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PEX11AO75192 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PEX11AO75192 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PEX11AO75192 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PEX11AO75192 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PEX11AO75192 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PEX11AO75192 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PEX11AO75192 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PEX11AO75192 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PEX11AO75192 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PEX11AO75192 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PEX11AO75192 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PEX11AO75192 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PEX11AO75192 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PEX11AO75192 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PEX11AO75192 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PEX11AO75192 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PEX11AO75192 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PEX11AO75192 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PEX11AO75192 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PEX11AO75192 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PEX11AO75192 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PEX11AO75192 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms