Protein–RNA interactions for Protein: O60568

PLOD3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, humanhuman

Predictions only

Length 738 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD3O60568 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLOD3O60568 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLOD3O60568 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PLOD3O60568 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLOD3O60568 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLOD3O60568 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLOD3O60568 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLOD3O60568 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLOD3O60568 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLOD3O60568 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLOD3O60568 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLOD3O60568 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLOD3O60568 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLOD3O60568 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLOD3O60568 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLOD3O60568 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLOD3O60568 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLOD3O60568 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLOD3O60568 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLOD3O60568 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLOD3O60568 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLOD3O60568 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLOD3O60568 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLOD3O60568 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLOD3O60568 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLOD3O60568 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLOD3O60568 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLOD3O60568 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLOD3O60568 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLOD3O60568 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PLOD3O60568 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PLOD3O60568 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLOD3O60568 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLOD3O60568 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PLOD3O60568 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLOD3O60568 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLOD3O60568 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLOD3O60568 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PLOD3O60568 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLOD3O60568 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLOD3O60568 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLOD3O60568 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLOD3O60568 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PLOD3O60568 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PLOD3O60568 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLOD3O60568 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLOD3O60568 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLOD3O60568 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLOD3O60568 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLOD3O60568 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLOD3O60568 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLOD3O60568 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLOD3O60568 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLOD3O60568 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLOD3O60568 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLOD3O60568 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PLOD3O60568 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLOD3O60568 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLOD3O60568 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLOD3O60568 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLOD3O60568 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLOD3O60568 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLOD3O60568 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PLOD3O60568 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLOD3O60568 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PLOD3O60568 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLOD3O60568 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLOD3O60568 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLOD3O60568 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLOD3O60568 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLOD3O60568 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLOD3O60568 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLOD3O60568 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLOD3O60568 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLOD3O60568 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLOD3O60568 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLOD3O60568 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLOD3O60568 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLOD3O60568 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLOD3O60568 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLOD3O60568 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLOD3O60568 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PLOD3O60568 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLOD3O60568 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLOD3O60568 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLOD3O60568 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLOD3O60568 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLOD3O60568 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLOD3O60568 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLOD3O60568 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLOD3O60568 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PLOD3O60568 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PLOD3O60568 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PLOD3O60568 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PLOD3O60568 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PLOD3O60568 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLOD3O60568 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PLOD3O60568 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLOD3O60568 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLOD3O60568 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms