Protein–RNA interactions for Protein: O43868

SLC28A2, Sodium/nucleoside cotransporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC28A2O43868 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC28A2O43868 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC28A2O43868 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC28A2O43868 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC28A2O43868 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC28A2O43868 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC28A2O43868 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC28A2O43868 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC28A2O43868 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC28A2O43868 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC28A2O43868 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC28A2O43868 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC28A2O43868 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC28A2O43868 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC28A2O43868 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC28A2O43868 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC28A2O43868 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC28A2O43868 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC28A2O43868 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC28A2O43868 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC28A2O43868 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC28A2O43868 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC28A2O43868 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC28A2O43868 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC28A2O43868 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC28A2O43868 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC28A2O43868 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC28A2O43868 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC28A2O43868 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC28A2O43868 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC28A2O43868 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC28A2O43868 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC28A2O43868 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC28A2O43868 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC28A2O43868 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC28A2O43868 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC28A2O43868 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC28A2O43868 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC28A2O43868 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC28A2O43868 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC28A2O43868 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC28A2O43868 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC28A2O43868 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC28A2O43868 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC28A2O43868 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC28A2O43868 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC28A2O43868 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC28A2O43868 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC28A2O43868 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC28A2O43868 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC28A2O43868 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC28A2O43868 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC28A2O43868 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC28A2O43868 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC28A2O43868 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC28A2O43868 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC28A2O43868 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC28A2O43868 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC28A2O43868 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC28A2O43868 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC28A2O43868 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC28A2O43868 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC28A2O43868 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC28A2O43868 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC28A2O43868 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC28A2O43868 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC28A2O43868 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC28A2O43868 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC28A2O43868 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC28A2O43868 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC28A2O43868 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC28A2O43868 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC28A2O43868 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC28A2O43868 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC28A2O43868 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC28A2O43868 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC28A2O43868 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC28A2O43868 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC28A2O43868 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC28A2O43868 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC28A2O43868 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC28A2O43868 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC28A2O43868 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC28A2O43868 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC28A2O43868 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC28A2O43868 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC28A2O43868 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC28A2O43868 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC28A2O43868 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC28A2O43868 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC28A2O43868 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC28A2O43868 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC28A2O43868 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC28A2O43868 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC28A2O43868 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC28A2O43868 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC28A2O43868 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC28A2O43868 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC28A2O43868 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC28A2O43868 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms