Protein–RNA interactions for Protein: O14649

KCNK3, Potassium channel subfamily K member 3, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK3O14649 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNK3O14649 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNK3O14649 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNK3O14649 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNK3O14649 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNK3O14649 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNK3O14649 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KCNK3O14649 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KCNK3O14649 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
KCNK3O14649 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KCNK3O14649 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KCNK3O14649 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KCNK3O14649 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCNK3O14649 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCNK3O14649 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCNK3O14649 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
KCNK3O14649 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
KCNK3O14649 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCNK3O14649 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNK3O14649 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNK3O14649 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNK3O14649 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNK3O14649 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNK3O14649 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNK3O14649 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNK3O14649 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNK3O14649 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNK3O14649 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KCNK3O14649 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KCNK3O14649 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KCNK3O14649 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
KCNK3O14649 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNK3O14649 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNK3O14649 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNK3O14649 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNK3O14649 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNK3O14649 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNK3O14649 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNK3O14649 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNK3O14649 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNK3O14649 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNK3O14649 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNK3O14649 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNK3O14649 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNK3O14649 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNK3O14649 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNK3O14649 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNK3O14649 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNK3O14649 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNK3O14649 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNK3O14649 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNK3O14649 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNK3O14649 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNK3O14649 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNK3O14649 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNK3O14649 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNK3O14649 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNK3O14649 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNK3O14649 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNK3O14649 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNK3O14649 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNK3O14649 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNK3O14649 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNK3O14649 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNK3O14649 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNK3O14649 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNK3O14649 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNK3O14649 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNK3O14649 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNK3O14649 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNK3O14649 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNK3O14649 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNK3O14649 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNK3O14649 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNK3O14649 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNK3O14649 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNK3O14649 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNK3O14649 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNK3O14649 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNK3O14649 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNK3O14649 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
KCNK3O14649 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNK3O14649 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNK3O14649 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNK3O14649 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNK3O14649 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNK3O14649 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNK3O14649 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNK3O14649 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNK3O14649 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNK3O14649 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNK3O14649 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNK3O14649 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNK3O14649 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNK3O14649 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNK3O14649 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNK3O14649 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNK3O14649 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNK3O14649 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNK3O14649 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms