Protein–RNA interactions for Protein: O00311

CDC7, Cell division cycle 7-related protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC7O00311 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDC7O00311 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDC7O00311 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDC7O00311 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDC7O00311 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDC7O00311 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDC7O00311 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CDC7O00311 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDC7O00311 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDC7O00311 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDC7O00311 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDC7O00311 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDC7O00311 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDC7O00311 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDC7O00311 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDC7O00311 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDC7O00311 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDC7O00311 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDC7O00311 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDC7O00311 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDC7O00311 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDC7O00311 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC7O00311 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC7O00311 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC7O00311 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC7O00311 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC7O00311 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC7O00311 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC7O00311 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC7O00311 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC7O00311 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC7O00311 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC7O00311 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC7O00311 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDC7O00311 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDC7O00311 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CDC7O00311 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDC7O00311 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
CDC7O00311 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDC7O00311 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDC7O00311 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDC7O00311 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDC7O00311 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDC7O00311 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDC7O00311 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDC7O00311 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDC7O00311 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDC7O00311 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDC7O00311 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDC7O00311 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDC7O00311 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDC7O00311 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDC7O00311 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDC7O00311 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDC7O00311 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDC7O00311 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDC7O00311 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDC7O00311 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDC7O00311 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDC7O00311 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDC7O00311 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDC7O00311 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDC7O00311 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDC7O00311 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDC7O00311 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDC7O00311 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDC7O00311 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDC7O00311 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDC7O00311 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDC7O00311 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CDC7O00311 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDC7O00311 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDC7O00311 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDC7O00311 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDC7O00311 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDC7O00311 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDC7O00311 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDC7O00311 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDC7O00311 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CDC7O00311 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDC7O00311 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDC7O00311 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDC7O00311 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CDC7O00311 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDC7O00311 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDC7O00311 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDC7O00311 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDC7O00311 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDC7O00311 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDC7O00311 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDC7O00311 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDC7O00311 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CDC7O00311 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDC7O00311 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDC7O00311 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDC7O00311 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDC7O00311 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDC7O00311 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDC7O00311 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDC7O00311 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms