Protein–RNA interactions for Protein: A6NNA2

SRRM3, Serine/arginine repetitive matrix protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM3A6NNA2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRRM3A6NNA2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRRM3A6NNA2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRRM3A6NNA2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRRM3A6NNA2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRRM3A6NNA2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRRM3A6NNA2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRRM3A6NNA2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRRM3A6NNA2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRRM3A6NNA2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRRM3A6NNA2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRRM3A6NNA2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRRM3A6NNA2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRRM3A6NNA2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRRM3A6NNA2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRRM3A6NNA2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SRRM3A6NNA2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRRM3A6NNA2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRRM3A6NNA2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRRM3A6NNA2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRRM3A6NNA2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRRM3A6NNA2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRRM3A6NNA2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRRM3A6NNA2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRRM3A6NNA2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRRM3A6NNA2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRRM3A6NNA2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRRM3A6NNA2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRRM3A6NNA2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRRM3A6NNA2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRRM3A6NNA2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRRM3A6NNA2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SRRM3A6NNA2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRRM3A6NNA2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRRM3A6NNA2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRRM3A6NNA2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRRM3A6NNA2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRRM3A6NNA2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRRM3A6NNA2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRRM3A6NNA2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRRM3A6NNA2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRRM3A6NNA2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRRM3A6NNA2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRRM3A6NNA2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRRM3A6NNA2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRRM3A6NNA2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SRRM3A6NNA2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRRM3A6NNA2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRRM3A6NNA2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRRM3A6NNA2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRRM3A6NNA2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRRM3A6NNA2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRRM3A6NNA2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRRM3A6NNA2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRRM3A6NNA2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRRM3A6NNA2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRRM3A6NNA2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRRM3A6NNA2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRRM3A6NNA2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRRM3A6NNA2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SRRM3A6NNA2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SRRM3A6NNA2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRRM3A6NNA2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRRM3A6NNA2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SRRM3A6NNA2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SRRM3A6NNA2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SRRM3A6NNA2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SRRM3A6NNA2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SRRM3A6NNA2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SRRM3A6NNA2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SRRM3A6NNA2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SRRM3A6NNA2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SRRM3A6NNA2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SRRM3A6NNA2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRRM3A6NNA2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SRRM3A6NNA2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRRM3A6NNA2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRRM3A6NNA2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRRM3A6NNA2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRRM3A6NNA2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRRM3A6NNA2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRRM3A6NNA2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRRM3A6NNA2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRRM3A6NNA2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRRM3A6NNA2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SRRM3A6NNA2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SRRM3A6NNA2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRRM3A6NNA2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRRM3A6NNA2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SRRM3A6NNA2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRRM3A6NNA2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRRM3A6NNA2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SRRM3A6NNA2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SRRM3A6NNA2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SRRM3A6NNA2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SRRM3A6NNA2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SRRM3A6NNA2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SRRM3A6NNA2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SRRM3A6NNA2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SRRM3A6NNA2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms