Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQS6

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQS6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
A0A0U1RQS6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
A0A0U1RQS6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
A0A0U1RQS6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
A0A0U1RQS6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
A0A0U1RQS6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
A0A0U1RQS6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
A0A0U1RQS6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
A0A0U1RQS6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
A0A0U1RQS6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
A0A0U1RQS6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
A0A0U1RQS6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
A0A0U1RQS6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
A0A0U1RQS6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
A0A0U1RQS6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
A0A0U1RQS6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
A0A0U1RQS6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
A0A0U1RQS6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
A0A0U1RQS6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
A0A0U1RQS6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
A0A0U1RQS6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
A0A0U1RQS6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
A0A0U1RQS6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
A0A0U1RQS6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
A0A0U1RQS6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
A0A0U1RQS6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
A0A0U1RQS6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
A0A0U1RQS6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
A0A0U1RQS6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
A0A0U1RQS6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
A0A0U1RQS6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
A0A0U1RQS6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
A0A0U1RQS6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
A0A0U1RQS6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
A0A0U1RQS6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
A0A0U1RQS6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
A0A0U1RQS6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
A0A0U1RQS6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
A0A0U1RQS6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
A0A0U1RQS6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
A0A0U1RQS6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
A0A0U1RQS6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
A0A0U1RQS6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
A0A0U1RQS6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
A0A0U1RQS6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
A0A0U1RQS6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
A0A0U1RQS6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
A0A0U1RQS6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
A0A0U1RQS6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
A0A0U1RQS6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
A0A0U1RQS6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
A0A0U1RQS6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
A0A0U1RQS6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
A0A0U1RQS6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
A0A0U1RQS6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
A0A0U1RQS6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
A0A0U1RQS6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
A0A0U1RQS6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
A0A0U1RQS6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
A0A0U1RQS6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
A0A0U1RQS6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
A0A0U1RQS6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
A0A0U1RQS6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
A0A0U1RQS6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
A0A0U1RQS6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
A0A0U1RQS6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
A0A0U1RQS6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
A0A0U1RQS6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
A0A0U1RQS6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
A0A0U1RQS6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
A0A0U1RQS6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
A0A0U1RQS6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
A0A0U1RQS6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
A0A0U1RQS6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
A0A0U1RQS6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
A0A0U1RQS6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
A0A0U1RQS6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
A0A0U1RQS6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
A0A0U1RQS6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
A0A0U1RQS6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
A0A0U1RQS6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
A0A0U1RQS6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
A0A0U1RQS6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
A0A0U1RQS6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
A0A0U1RQS6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
A0A0U1RQS6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
A0A0U1RQS6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
A0A0U1RQS6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
A0A0U1RQS6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
A0A0U1RQS6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
A0A0U1RQS6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
A0A0U1RQS6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
A0A0U1RQS6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
A0A0U1RQS6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
A0A0U1RQS6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
A0A0U1RQS6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
A0A0U1RQS6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
A0A0U1RQS6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
A0A0U1RQS6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
A0A0U1RQS6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms