Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y7

LYVE1, Lymphatic vessel endothelial hyaluronic acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYVE1Q9Y5Y7 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LYVE1Q9Y5Y7 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms