Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E8

USP15, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15Q9Y4E8 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP15Q9Y4E8 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP15Q9Y4E8 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP15Q9Y4E8 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP15Q9Y4E8 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP15Q9Y4E8 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
USP15Q9Y4E8 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP15Q9Y4E8 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP15Q9Y4E8 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP15Q9Y4E8 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP15Q9Y4E8 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP15Q9Y4E8 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP15Q9Y4E8 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP15Q9Y4E8 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP15Q9Y4E8 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP15Q9Y4E8 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP15Q9Y4E8 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP15Q9Y4E8 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP15Q9Y4E8 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
USP15Q9Y4E8 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP15Q9Y4E8 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP15Q9Y4E8 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP15Q9Y4E8 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP15Q9Y4E8 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP15Q9Y4E8 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP15Q9Y4E8 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP15Q9Y4E8 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP15Q9Y4E8 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP15Q9Y4E8 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP15Q9Y4E8 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP15Q9Y4E8 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP15Q9Y4E8 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP15Q9Y4E8 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP15Q9Y4E8 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP15Q9Y4E8 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
USP15Q9Y4E8 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
USP15Q9Y4E8 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
USP15Q9Y4E8 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
USP15Q9Y4E8 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
USP15Q9Y4E8 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
USP15Q9Y4E8 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
USP15Q9Y4E8 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
USP15Q9Y4E8 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
USP15Q9Y4E8 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP15Q9Y4E8 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP15Q9Y4E8 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP15Q9Y4E8 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP15Q9Y4E8 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP15Q9Y4E8 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP15Q9Y4E8 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP15Q9Y4E8 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP15Q9Y4E8 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP15Q9Y4E8 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP15Q9Y4E8 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP15Q9Y4E8 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP15Q9Y4E8 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP15Q9Y4E8 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP15Q9Y4E8 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP15Q9Y4E8 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP15Q9Y4E8 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP15Q9Y4E8 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP15Q9Y4E8 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP15Q9Y4E8 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP15Q9Y4E8 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP15Q9Y4E8 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP15Q9Y4E8 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
USP15Q9Y4E8 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP15Q9Y4E8 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP15Q9Y4E8 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP15Q9Y4E8 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP15Q9Y4E8 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP15Q9Y4E8 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP15Q9Y4E8 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP15Q9Y4E8 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP15Q9Y4E8 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP15Q9Y4E8 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP15Q9Y4E8 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP15Q9Y4E8 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP15Q9Y4E8 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP15Q9Y4E8 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP15Q9Y4E8 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP15Q9Y4E8 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP15Q9Y4E8 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP15Q9Y4E8 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP15Q9Y4E8 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP15Q9Y4E8 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP15Q9Y4E8 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP15Q9Y4E8 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP15Q9Y4E8 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP15Q9Y4E8 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP15Q9Y4E8 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP15Q9Y4E8 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP15Q9Y4E8 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP15Q9Y4E8 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP15Q9Y4E8 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP15Q9Y4E8 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP15Q9Y4E8 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP15Q9Y4E8 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP15Q9Y4E8 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP15Q9Y4E8 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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