Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L6

FRMD4B, FERM domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 1,034 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD4BQ9Y2L6 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FRMD4BQ9Y2L6 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FRMD4BQ9Y2L6 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FRMD4BQ9Y2L6 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FRMD4BQ9Y2L6 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FRMD4BQ9Y2L6 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FRMD4BQ9Y2L6 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FRMD4BQ9Y2L6 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FRMD4BQ9Y2L6 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FRMD4BQ9Y2L6 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FRMD4BQ9Y2L6 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FRMD4BQ9Y2L6 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FRMD4BQ9Y2L6 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FRMD4BQ9Y2L6 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FRMD4BQ9Y2L6 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FRMD4BQ9Y2L6 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FRMD4BQ9Y2L6 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FRMD4BQ9Y2L6 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
FRMD4BQ9Y2L6 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FRMD4BQ9Y2L6 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FRMD4BQ9Y2L6 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FRMD4BQ9Y2L6 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FRMD4BQ9Y2L6 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FRMD4BQ9Y2L6 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FRMD4BQ9Y2L6 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FRMD4BQ9Y2L6 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FRMD4BQ9Y2L6 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FRMD4BQ9Y2L6 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FRMD4BQ9Y2L6 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FRMD4BQ9Y2L6 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FRMD4BQ9Y2L6 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FRMD4BQ9Y2L6 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FRMD4BQ9Y2L6 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FRMD4BQ9Y2L6 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FRMD4BQ9Y2L6 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FRMD4BQ9Y2L6 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FRMD4BQ9Y2L6 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FRMD4BQ9Y2L6 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FRMD4BQ9Y2L6 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FRMD4BQ9Y2L6 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FRMD4BQ9Y2L6 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FRMD4BQ9Y2L6 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FRMD4BQ9Y2L6 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FRMD4BQ9Y2L6 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FRMD4BQ9Y2L6 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FRMD4BQ9Y2L6 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FRMD4BQ9Y2L6 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FRMD4BQ9Y2L6 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FRMD4BQ9Y2L6 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FRMD4BQ9Y2L6 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FRMD4BQ9Y2L6 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FRMD4BQ9Y2L6 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FRMD4BQ9Y2L6 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FRMD4BQ9Y2L6 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FRMD4BQ9Y2L6 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FRMD4BQ9Y2L6 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FRMD4BQ9Y2L6 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
FRMD4BQ9Y2L6 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FRMD4BQ9Y2L6 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FRMD4BQ9Y2L6 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FRMD4BQ9Y2L6 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FRMD4BQ9Y2L6 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FRMD4BQ9Y2L6 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FRMD4BQ9Y2L6 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FRMD4BQ9Y2L6 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FRMD4BQ9Y2L6 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FRMD4BQ9Y2L6 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FRMD4BQ9Y2L6 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FRMD4BQ9Y2L6 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FRMD4BQ9Y2L6 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
FRMD4BQ9Y2L6 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
FRMD4BQ9Y2L6 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FRMD4BQ9Y2L6 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
FRMD4BQ9Y2L6 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FRMD4BQ9Y2L6 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FRMD4BQ9Y2L6 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FRMD4BQ9Y2L6 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FRMD4BQ9Y2L6 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FRMD4BQ9Y2L6 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FRMD4BQ9Y2L6 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FRMD4BQ9Y2L6 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FRMD4BQ9Y2L6 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FRMD4BQ9Y2L6 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FRMD4BQ9Y2L6 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FRMD4BQ9Y2L6 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FRMD4BQ9Y2L6 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FRMD4BQ9Y2L6 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FRMD4BQ9Y2L6 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FRMD4BQ9Y2L6 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FRMD4BQ9Y2L6 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FRMD4BQ9Y2L6 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FRMD4BQ9Y2L6 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FRMD4BQ9Y2L6 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FRMD4BQ9Y2L6 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FRMD4BQ9Y2L6 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FRMD4BQ9Y2L6 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FRMD4BQ9Y2L6 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FRMD4BQ9Y2L6 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FRMD4BQ9Y2L6 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FRMD4BQ9Y2L6 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms