Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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RAB23Q9ULC3 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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RAB23Q9ULC3 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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RAB23Q9ULC3 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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RAB23Q9ULC3 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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RAB23Q9ULC3 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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RAB23Q9ULC3 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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RAB23Q9ULC3 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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RAB23Q9ULC3 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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RAB23Q9ULC3 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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RAB23Q9ULC3 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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RAB23Q9ULC3 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB23Q9ULC3 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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