Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.5 ms