Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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SH3BP4Q9P0V3 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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SH3BP4Q9P0V3 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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SH3BP4Q9P0V3 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
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SH3BP4Q9P0V3 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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SH3BP4Q9P0V3 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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SH3BP4Q9P0V3 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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SH3BP4Q9P0V3 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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SH3BP4Q9P0V3 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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SH3BP4Q9P0V3 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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