Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZR2

LRP1B, Low-density lipoprotein receptor-related protein 1B, humanhuman

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Length 4,599 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1BQ9NZR2 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LRP1BQ9NZR2 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
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