Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MIS18AQ9NYP9 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MIS18AQ9NYP9 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MIS18AQ9NYP9 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MIS18AQ9NYP9 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MIS18AQ9NYP9 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MIS18AQ9NYP9 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MIS18AQ9NYP9 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MIS18AQ9NYP9 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MIS18AQ9NYP9 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MIS18AQ9NYP9 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MIS18AQ9NYP9 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MIS18AQ9NYP9 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MIS18AQ9NYP9 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MIS18AQ9NYP9 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MIS18AQ9NYP9 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MIS18AQ9NYP9 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MIS18AQ9NYP9 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MIS18AQ9NYP9 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MIS18AQ9NYP9 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MIS18AQ9NYP9 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
MIS18AQ9NYP9 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
MIS18AQ9NYP9 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MIS18AQ9NYP9 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
MIS18AQ9NYP9 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
MIS18AQ9NYP9 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MIS18AQ9NYP9 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MIS18AQ9NYP9 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MIS18AQ9NYP9 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MIS18AQ9NYP9 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
MIS18AQ9NYP9 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MIS18AQ9NYP9 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MIS18AQ9NYP9 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MIS18AQ9NYP9 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MIS18AQ9NYP9 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MIS18AQ9NYP9 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
MIS18AQ9NYP9 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MIS18AQ9NYP9 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MIS18AQ9NYP9 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MIS18AQ9NYP9 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MIS18AQ9NYP9 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MIS18AQ9NYP9 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MIS18AQ9NYP9 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MIS18AQ9NYP9 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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MIS18AQ9NYP9 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MIS18AQ9NYP9 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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MIS18AQ9NYP9 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MIS18AQ9NYP9 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MIS18AQ9NYP9 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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MIS18AQ9NYP9 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MIS18AQ9NYP9 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
MIS18AQ9NYP9 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MIS18AQ9NYP9 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MIS18AQ9NYP9 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
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MIS18AQ9NYP9 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MIS18AQ9NYP9 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MIS18AQ9NYP9 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MIS18AQ9NYP9 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
MIS18AQ9NYP9 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MIS18AQ9NYP9 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MIS18AQ9NYP9 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
MIS18AQ9NYP9 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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MIS18AQ9NYP9 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MIS18AQ9NYP9 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
MIS18AQ9NYP9 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
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MIS18AQ9NYP9 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
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MIS18AQ9NYP9 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MIS18AQ9NYP9 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
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MIS18AQ9NYP9 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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MIS18AQ9NYP9 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
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MIS18AQ9NYP9 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MIS18AQ9NYP9 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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