Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXC10Q9NYD6 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXC10Q9NYD6 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXC10Q9NYD6 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXC10Q9NYD6 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXC10Q9NYD6 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXC10Q9NYD6 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXC10Q9NYD6 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXC10Q9NYD6 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXC10Q9NYD6 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXC10Q9NYD6 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXC10Q9NYD6 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXC10Q9NYD6 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXC10Q9NYD6 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXC10Q9NYD6 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXC10Q9NYD6 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXC10Q9NYD6 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXC10Q9NYD6 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXC10Q9NYD6 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXC10Q9NYD6 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXC10Q9NYD6 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXC10Q9NYD6 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXC10Q9NYD6 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXC10Q9NYD6 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXC10Q9NYD6 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXC10Q9NYD6 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXC10Q9NYD6 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXC10Q9NYD6 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXC10Q9NYD6 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXC10Q9NYD6 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXC10Q9NYD6 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXC10Q9NYD6 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXC10Q9NYD6 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXC10Q9NYD6 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXC10Q9NYD6 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXC10Q9NYD6 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXC10Q9NYD6 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXC10Q9NYD6 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXC10Q9NYD6 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXC10Q9NYD6 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXC10Q9NYD6 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXC10Q9NYD6 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXC10Q9NYD6 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXC10Q9NYD6 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXC10Q9NYD6 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXC10Q9NYD6 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXC10Q9NYD6 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXC10Q9NYD6 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXC10Q9NYD6 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXC10Q9NYD6 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXC10Q9NYD6 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXC10Q9NYD6 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXC10Q9NYD6 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXC10Q9NYD6 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXC10Q9NYD6 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXC10Q9NYD6 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXC10Q9NYD6 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXC10Q9NYD6 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXC10Q9NYD6 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXC10Q9NYD6 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXC10Q9NYD6 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXC10Q9NYD6 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXC10Q9NYD6 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXC10Q9NYD6 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXC10Q9NYD6 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXC10Q9NYD6 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXC10Q9NYD6 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXC10Q9NYD6 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXC10Q9NYD6 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXC10Q9NYD6 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXC10Q9NYD6 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXC10Q9NYD6 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXC10Q9NYD6 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXC10Q9NYD6 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXC10Q9NYD6 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXC10Q9NYD6 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXC10Q9NYD6 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXC10Q9NYD6 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXC10Q9NYD6 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXC10Q9NYD6 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXC10Q9NYD6 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXC10Q9NYD6 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXC10Q9NYD6 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXC10Q9NYD6 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXC10Q9NYD6 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXC10Q9NYD6 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXC10Q9NYD6 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXC10Q9NYD6 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXC10Q9NYD6 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXC10Q9NYD6 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXC10Q9NYD6 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXC10Q9NYD6 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXC10Q9NYD6 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXC10Q9NYD6 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXC10Q9NYD6 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXC10Q9NYD6 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXC10Q9NYD6 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXC10Q9NYD6 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXC10Q9NYD6 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXC10Q9NYD6 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
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