Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD43

PTPRH, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase H, humanhuman

Predictions only

Length 1,115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRHQ9HD43 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRHQ9HD43 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRHQ9HD43 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRHQ9HD43 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRHQ9HD43 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRHQ9HD43 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRHQ9HD43 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRHQ9HD43 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRHQ9HD43 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRHQ9HD43 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRHQ9HD43 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRHQ9HD43 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRHQ9HD43 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTPRHQ9HD43 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTPRHQ9HD43 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTPRHQ9HD43 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRHQ9HD43 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRHQ9HD43 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRHQ9HD43 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRHQ9HD43 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRHQ9HD43 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRHQ9HD43 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRHQ9HD43 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRHQ9HD43 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRHQ9HD43 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRHQ9HD43 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRHQ9HD43 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRHQ9HD43 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRHQ9HD43 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRHQ9HD43 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRHQ9HD43 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRHQ9HD43 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRHQ9HD43 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRHQ9HD43 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRHQ9HD43 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRHQ9HD43 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRHQ9HD43 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRHQ9HD43 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRHQ9HD43 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRHQ9HD43 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRHQ9HD43 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRHQ9HD43 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRHQ9HD43 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRHQ9HD43 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRHQ9HD43 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRHQ9HD43 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRHQ9HD43 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRHQ9HD43 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRHQ9HD43 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRHQ9HD43 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRHQ9HD43 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRHQ9HD43 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRHQ9HD43 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRHQ9HD43 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRHQ9HD43 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRHQ9HD43 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRHQ9HD43 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRHQ9HD43 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRHQ9HD43 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRHQ9HD43 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRHQ9HD43 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRHQ9HD43 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRHQ9HD43 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRHQ9HD43 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRHQ9HD43 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRHQ9HD43 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRHQ9HD43 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRHQ9HD43 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRHQ9HD43 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRHQ9HD43 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRHQ9HD43 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRHQ9HD43 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRHQ9HD43 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRHQ9HD43 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRHQ9HD43 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRHQ9HD43 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRHQ9HD43 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRHQ9HD43 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRHQ9HD43 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRHQ9HD43 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRHQ9HD43 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRHQ9HD43 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRHQ9HD43 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRHQ9HD43 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRHQ9HD43 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRHQ9HD43 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRHQ9HD43 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRHQ9HD43 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRHQ9HD43 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRHQ9HD43 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRHQ9HD43 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRHQ9HD43 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRHQ9HD43 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRHQ9HD43 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRHQ9HD43 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRHQ9HD43 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRHQ9HD43 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRHQ9HD43 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRHQ9HD43 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRHQ9HD43 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms