Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

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Length 922 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP29Q9HBJ7 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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