Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4Q4

PRDM12, PR domain zinc finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12Q9H4Q4 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRDM12Q9H4Q4 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRDM12Q9H4Q4 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRDM12Q9H4Q4 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRDM12Q9H4Q4 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRDM12Q9H4Q4 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRDM12Q9H4Q4 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRDM12Q9H4Q4 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRDM12Q9H4Q4 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRDM12Q9H4Q4 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRDM12Q9H4Q4 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRDM12Q9H4Q4 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRDM12Q9H4Q4 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRDM12Q9H4Q4 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRDM12Q9H4Q4 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRDM12Q9H4Q4 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRDM12Q9H4Q4 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRDM12Q9H4Q4 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PRDM12Q9H4Q4 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PRDM12Q9H4Q4 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRDM12Q9H4Q4 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRDM12Q9H4Q4 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRDM12Q9H4Q4 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRDM12Q9H4Q4 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRDM12Q9H4Q4 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRDM12Q9H4Q4 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRDM12Q9H4Q4 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRDM12Q9H4Q4 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRDM12Q9H4Q4 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PRDM12Q9H4Q4 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PRDM12Q9H4Q4 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PRDM12Q9H4Q4 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PRDM12Q9H4Q4 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PRDM12Q9H4Q4 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
PRDM12Q9H4Q4 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PRDM12Q9H4Q4 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PRDM12Q9H4Q4 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PRDM12Q9H4Q4 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRDM12Q9H4Q4 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRDM12Q9H4Q4 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRDM12Q9H4Q4 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRDM12Q9H4Q4 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRDM12Q9H4Q4 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRDM12Q9H4Q4 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRDM12Q9H4Q4 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRDM12Q9H4Q4 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRDM12Q9H4Q4 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRDM12Q9H4Q4 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PRDM12Q9H4Q4 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRDM12Q9H4Q4 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRDM12Q9H4Q4 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRDM12Q9H4Q4 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRDM12Q9H4Q4 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRDM12Q9H4Q4 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRDM12Q9H4Q4 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRDM12Q9H4Q4 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PRDM12Q9H4Q4 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRDM12Q9H4Q4 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PRDM12Q9H4Q4 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRDM12Q9H4Q4 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRDM12Q9H4Q4 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRDM12Q9H4Q4 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRDM12Q9H4Q4 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRDM12Q9H4Q4 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRDM12Q9H4Q4 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRDM12Q9H4Q4 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRDM12Q9H4Q4 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRDM12Q9H4Q4 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRDM12Q9H4Q4 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRDM12Q9H4Q4 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRDM12Q9H4Q4 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRDM12Q9H4Q4 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRDM12Q9H4Q4 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRDM12Q9H4Q4 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRDM12Q9H4Q4 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRDM12Q9H4Q4 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRDM12Q9H4Q4 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRDM12Q9H4Q4 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRDM12Q9H4Q4 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRDM12Q9H4Q4 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRDM12Q9H4Q4 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRDM12Q9H4Q4 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRDM12Q9H4Q4 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRDM12Q9H4Q4 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRDM12Q9H4Q4 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRDM12Q9H4Q4 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRDM12Q9H4Q4 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRDM12Q9H4Q4 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRDM12Q9H4Q4 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRDM12Q9H4Q4 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRDM12Q9H4Q4 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PRDM12Q9H4Q4 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRDM12Q9H4Q4 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRDM12Q9H4Q4 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PRDM12Q9H4Q4 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRDM12Q9H4Q4 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRDM12Q9H4Q4 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PRDM12Q9H4Q4 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRDM12Q9H4Q4 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PRDM12Q9H4Q4 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.8 ms