Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZL8

BPESC1, Putative BPES syndrome breakpoint region protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPESC1Q9GZL8 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC13.61□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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