Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms