Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLF1Q9BQI6 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLF1Q9BQI6 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLF1Q9BQI6 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLF1Q9BQI6 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLF1Q9BQI6 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLF1Q9BQI6 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLF1Q9BQI6 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLF1Q9BQI6 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLF1Q9BQI6 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLF1Q9BQI6 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLF1Q9BQI6 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLF1Q9BQI6 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLF1Q9BQI6 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLF1Q9BQI6 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLF1Q9BQI6 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLF1Q9BQI6 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLF1Q9BQI6 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLF1Q9BQI6 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLF1Q9BQI6 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLF1Q9BQI6 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLF1Q9BQI6 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLF1Q9BQI6 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLF1Q9BQI6 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLF1Q9BQI6 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLF1Q9BQI6 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLF1Q9BQI6 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLF1Q9BQI6 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLF1Q9BQI6 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SLF1Q9BQI6 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLF1Q9BQI6 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLF1Q9BQI6 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLF1Q9BQI6 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLF1Q9BQI6 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLF1Q9BQI6 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLF1Q9BQI6 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLF1Q9BQI6 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLF1Q9BQI6 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLF1Q9BQI6 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLF1Q9BQI6 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLF1Q9BQI6 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLF1Q9BQI6 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLF1Q9BQI6 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLF1Q9BQI6 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLF1Q9BQI6 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLF1Q9BQI6 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLF1Q9BQI6 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLF1Q9BQI6 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLF1Q9BQI6 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SLF1Q9BQI6 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLF1Q9BQI6 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLF1Q9BQI6 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLF1Q9BQI6 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLF1Q9BQI6 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLF1Q9BQI6 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SLF1Q9BQI6 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLF1Q9BQI6 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLF1Q9BQI6 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLF1Q9BQI6 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLF1Q9BQI6 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLF1Q9BQI6 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SLF1Q9BQI6 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLF1Q9BQI6 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLF1Q9BQI6 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLF1Q9BQI6 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLF1Q9BQI6 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SLF1Q9BQI6 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SLF1Q9BQI6 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLF1Q9BQI6 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLF1Q9BQI6 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SLF1Q9BQI6 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLF1Q9BQI6 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLF1Q9BQI6 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLF1Q9BQI6 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLF1Q9BQI6 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLF1Q9BQI6 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLF1Q9BQI6 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLF1Q9BQI6 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLF1Q9BQI6 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLF1Q9BQI6 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLF1Q9BQI6 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLF1Q9BQI6 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLF1Q9BQI6 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLF1Q9BQI6 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLF1Q9BQI6 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLF1Q9BQI6 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLF1Q9BQI6 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLF1Q9BQI6 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLF1Q9BQI6 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLF1Q9BQI6 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLF1Q9BQI6 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLF1Q9BQI6 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLF1Q9BQI6 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLF1Q9BQI6 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLF1Q9BQI6 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLF1Q9BQI6 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLF1Q9BQI6 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLF1Q9BQI6 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLF1Q9BQI6 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SLF1Q9BQI6 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms