Protein–RNA interactions for Protein: Q96L96

ALPK3, Alpha-protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK3Q96L96 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ALPK3Q96L96 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ALPK3Q96L96 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ALPK3Q96L96 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ALPK3Q96L96 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ALPK3Q96L96 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ALPK3Q96L96 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ALPK3Q96L96 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ALPK3Q96L96 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ALPK3Q96L96 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ALPK3Q96L96 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ALPK3Q96L96 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ALPK3Q96L96 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ALPK3Q96L96 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ALPK3Q96L96 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ALPK3Q96L96 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ALPK3Q96L96 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ALPK3Q96L96 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ALPK3Q96L96 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ALPK3Q96L96 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ALPK3Q96L96 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ALPK3Q96L96 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ALPK3Q96L96 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ALPK3Q96L96 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ALPK3Q96L96 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ALPK3Q96L96 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ALPK3Q96L96 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ALPK3Q96L96 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ALPK3Q96L96 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ALPK3Q96L96 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ALPK3Q96L96 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ALPK3Q96L96 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ALPK3Q96L96 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ALPK3Q96L96 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ALPK3Q96L96 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ALPK3Q96L96 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ALPK3Q96L96 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ALPK3Q96L96 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ALPK3Q96L96 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ALPK3Q96L96 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ALPK3Q96L96 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ALPK3Q96L96 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ALPK3Q96L96 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ALPK3Q96L96 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ALPK3Q96L96 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ALPK3Q96L96 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ALPK3Q96L96 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ALPK3Q96L96 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ALPK3Q96L96 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ALPK3Q96L96 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ALPK3Q96L96 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ALPK3Q96L96 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ALPK3Q96L96 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ALPK3Q96L96 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ALPK3Q96L96 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ALPK3Q96L96 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ALPK3Q96L96 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ALPK3Q96L96 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ALPK3Q96L96 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ALPK3Q96L96 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ALPK3Q96L96 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ALPK3Q96L96 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ALPK3Q96L96 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ALPK3Q96L96 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ALPK3Q96L96 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ALPK3Q96L96 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ALPK3Q96L96 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ALPK3Q96L96 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ALPK3Q96L96 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ALPK3Q96L96 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ALPK3Q96L96 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ALPK3Q96L96 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ALPK3Q96L96 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ALPK3Q96L96 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ALPK3Q96L96 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ALPK3Q96L96 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ALPK3Q96L96 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ALPK3Q96L96 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ALPK3Q96L96 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ALPK3Q96L96 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ALPK3Q96L96 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ALPK3Q96L96 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ALPK3Q96L96 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ALPK3Q96L96 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ALPK3Q96L96 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ALPK3Q96L96 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ALPK3Q96L96 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ALPK3Q96L96 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ALPK3Q96L96 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ALPK3Q96L96 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ALPK3Q96L96 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ALPK3Q96L96 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ALPK3Q96L96 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ALPK3Q96L96 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ALPK3Q96L96 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ALPK3Q96L96 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ALPK3Q96L96 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ALPK3Q96L96 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ALPK3Q96L96 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ALPK3Q96L96 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms