Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHDQ96IW2 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms