Protein–RNA interactions for Protein: Q96GP6

SCARF2, Scavenger receptor class F member 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF2Q96GP6 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCARF2Q96GP6 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms