Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ5

CLIP3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, humanhuman

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Length 547 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP3Q96DZ5 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CLIP3Q96DZ5 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLIP3Q96DZ5 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CLIP3Q96DZ5 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CLIP3Q96DZ5 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLIP3Q96DZ5 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLIP3Q96DZ5 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLIP3Q96DZ5 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLIP3Q96DZ5 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLIP3Q96DZ5 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLIP3Q96DZ5 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLIP3Q96DZ5 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLIP3Q96DZ5 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLIP3Q96DZ5 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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CLIP3Q96DZ5 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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CLIP3Q96DZ5 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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CLIP3Q96DZ5 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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CLIP3Q96DZ5 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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CLIP3Q96DZ5 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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CLIP3Q96DZ5 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLIP3Q96DZ5 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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