Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRUQ92729 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRUQ92729 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRUQ92729 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRUQ92729 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRUQ92729 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRUQ92729 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRUQ92729 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRUQ92729 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRUQ92729 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRUQ92729 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRUQ92729 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
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PTPRUQ92729 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
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PTPRUQ92729 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRUQ92729 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
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PTPRUQ92729 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRUQ92729 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRUQ92729 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRUQ92729 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRUQ92729 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRUQ92729 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRUQ92729 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRUQ92729 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRUQ92729 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRUQ92729 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
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PTPRUQ92729 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRUQ92729 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRUQ92729 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRUQ92729 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRUQ92729 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
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PTPRUQ92729 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRUQ92729 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
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PTPRUQ92729 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
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PTPRUQ92729 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
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PTPRUQ92729 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRUQ92729 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRUQ92729 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRUQ92729 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRUQ92729 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRUQ92729 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRUQ92729 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRUQ92729 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRUQ92729 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRUQ92729 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
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