Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBW4

SLC38A9, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 9, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A9Q8NBW4 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC38A9Q8NBW4 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC38A9Q8NBW4 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms