Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8U3

RTL3, Retrotransposon Gag-like protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL3Q8N8U3 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTL3Q8N8U3 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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