Protein–RNA interactions for Protein: Q76B58

BRINP3, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 3, humanhuman

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Length 766 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRINP3Q76B58 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
BRINP3Q76B58 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRINP3Q76B58 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRINP3Q76B58 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRINP3Q76B58 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRINP3Q76B58 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRINP3Q76B58 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRINP3Q76B58 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRINP3Q76B58 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRINP3Q76B58 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRINP3Q76B58 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRINP3Q76B58 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRINP3Q76B58 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRINP3Q76B58 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
BRINP3Q76B58 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
BRINP3Q76B58 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRINP3Q76B58 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRINP3Q76B58 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
BRINP3Q76B58 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRINP3Q76B58 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
BRINP3Q76B58 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRINP3Q76B58 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRINP3Q76B58 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRINP3Q76B58 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRINP3Q76B58 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRINP3Q76B58 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRINP3Q76B58 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRINP3Q76B58 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRINP3Q76B58 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRINP3Q76B58 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRINP3Q76B58 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRINP3Q76B58 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
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