Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD54Q6NXT1 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms