Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf135Q5VTT2 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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