Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KNOP1Q1ED39 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KNOP1Q1ED39 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
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