Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RTN1Q16799 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
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