Protein–RNA interactions for Protein: Q16663

CCL15, C-C motif chemokine 15, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL15Q16663 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCL15Q16663 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCL15Q16663 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCL15Q16663 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCL15Q16663 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCL15Q16663 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCL15Q16663 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCL15Q16663 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCL15Q16663 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCL15Q16663 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCL15Q16663 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCL15Q16663 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCL15Q16663 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCL15Q16663 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCL15Q16663 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCL15Q16663 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCL15Q16663 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCL15Q16663 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCL15Q16663 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCL15Q16663 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCL15Q16663 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCL15Q16663 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCL15Q16663 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CCL15Q16663 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CCL15Q16663 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CCL15Q16663 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CCL15Q16663 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCL15Q16663 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCL15Q16663 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCL15Q16663 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCL15Q16663 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCL15Q16663 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CCL15Q16663 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CCL15Q16663 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CCL15Q16663 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCL15Q16663 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCL15Q16663 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCL15Q16663 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCL15Q16663 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCL15Q16663 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCL15Q16663 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCL15Q16663 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCL15Q16663 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCL15Q16663 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCL15Q16663 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
CCL15Q16663 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCL15Q16663 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCL15Q16663 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCL15Q16663 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCL15Q16663 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCL15Q16663 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCL15Q16663 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCL15Q16663 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCL15Q16663 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCL15Q16663 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCL15Q16663 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCL15Q16663 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCL15Q16663 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCL15Q16663 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCL15Q16663 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CCL15Q16663 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCL15Q16663 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CCL15Q16663 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCL15Q16663 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CCL15Q16663 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CCL15Q16663 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCL15Q16663 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCL15Q16663 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCL15Q16663 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCL15Q16663 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCL15Q16663 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCL15Q16663 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCL15Q16663 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCL15Q16663 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCL15Q16663 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCL15Q16663 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCL15Q16663 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCL15Q16663 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCL15Q16663 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCL15Q16663 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCL15Q16663 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCL15Q16663 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCL15Q16663 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCL15Q16663 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCL15Q16663 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCL15Q16663 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCL15Q16663 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CCL15Q16663 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCL15Q16663 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CCL15Q16663 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCL15Q16663 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCL15Q16663 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCL15Q16663 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCL15Q16663 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CCL15Q16663 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CCL15Q16663 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCL15Q16663 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCL15Q16663 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCL15Q16663 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCL15Q16663 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms